焦文标
博士生导师
硕士生导师
教师姓名：焦文标
教师拼音名称：Jiao Wenbiao
职务：Professor
主要任职：College of Informatics, Huazhong Agricultural University
其他任职：果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室，湖北洪山实验室
职称：教授
学位：博士
办公地点：第一综合楼B620
电子邮箱：
毕业院校：德国马克斯普朗克植物育种研究所；德国科隆大学
所属院系：信息学院
所在单位：信息学院
学科：生物医学工程其他专业 生物信息学 生物学其他专业
其他联系方式
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研究方向
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研究方向
计算与进化基因组学
本方向主要研究领域：基因组组装、遗传变异与泛基因组等算法开发与应用 Development and application of algorithms for genome assembly and graph pangenomes
1） Genome Assembly 针对杂合二倍体、同源多倍体等复杂基因组，开发单倍型组装、Telomere-to-Telomere(T2T)组装算法，以获得高质量的柑橘、马铃薯等杂合二倍体或多倍体的完整单倍型序列。（Jiao et al., Genome Res. 2017; Sun et al., Nat. Genet. 2022; Xiao et a., Horti. Res. 2023）
2) Graph Pangenome 基于图形泛基因组理论，开发快速、高效、经济的遗传变异分型算法，解决当前算法对植物复杂变异分型效果较差的难题，并应用于柑橘、马铃薯等杂合二倍体和多倍体园艺作物，以及玉米、小麦等大型基因组的各类遗传变异（SNP、Indel、SV）的分型。（Du et., Genome Biology 2024）。
3）Population Genomics 通过大规模鉴定植物基因组遗传变异，开发比较或进化基因组学算法（例如：共线性多态性Syntenty diversity、跨物种超级泛基因组），解析基因组进化机制和遗传变异功能效应。(Jiao et al., Nat. Communi. 2021；Jiao et., Mol. Biol. Evol. 2022; Du et al., Plant Communications 2024)。
