张青叶，副教授，硕/博士生导师

Email: zqy@mail.hzau.edu.cn

研究简介：

      主要从事生物信息学、基于人工智能与多组学数据整合的药物发现等方面的研究。已主持国家重点研发计划子课题、国家自然科学基金、省科技创新技术重大专项子课题、博士后一等资助、博士后特别资助以及校培育专项等多个科研项目，以第一或通讯作者在 Briefings inBioinformatics，Plant Communications，Bioinformatics，Comput. Struct. Biotec. J.等SCI期刊上发表多个研究成果，获得授权发明专利、软件著作权多项。

近五年以通讯作者发表的论文：

1. Hao Tang, Feng Jiang, Zhi Zhang, Jiaojiao Yang, Lu Li, Qingye Zhang*, Metabolism-associated protein network constructing and host-directed anti-influenza drug repurposing. Briefings in Bioinformatics, 2025, 26(3), bbaf163

2. Yue Hu, Yao Ruan, Xin-Le Zhao, Feng Jiang, Dongxu Liu, Qiang Zhu, Qing-Ye Zhang*, Qing-Yong Yang^*. PCMD: A multilevel comparison database of intra- and cross-species metabolic profiling in 530 plant species. Plant Communications, 2024, 101038.

3. Hai-Long Yu †, Xiao-Long Liang †, Zhen-Yang Ge, Zhi Zhang, Yao Ruan, Hao Tang and Qing-Ye Zhang*. Metabolic Flux Analysis of Xanthomonas oryzae Treated with Bismerthiazol Revealed Glutathione Oxidoreductase in Glutathione Metabolism Serves as an Effective Target. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(22), 12236.  

4. Yanguang Liu, Hailong Yu^, Xinya Duan, Xiaomin Zhang, Ting Cheng, Feng Jiang, Hao Tang, Yao Ruan, Miao Zhang, Hongyu Zhang, Qing-Ye Zhang*. TransGEM: a molecule generation model based on Transformer with gene expression data. Bioinformatics, 2024, btae189.

5. Feng Jiang, Yao Ruan, Xiao-Hui Chen, Hai-Long Yu, Ting Cheng, Xin-Ya Duan, Yan-Guang Liu, Hong-Yu Zhang, Qing-Ye Zhang*. Metabolites of pathogenic microorganisms database (MPMdb) and its seed metabolite applications. MICROBIOLOGY SPECTRUM 4 (2024): e0234223-e0234223

6. Xiao-Hui Chen, Yao Ruan, Yan-Guang Liu, Xin-Ya Duan, Feng Jiang, Hao Tang, Hong-Yu Zhang, Qing-Ye Zhang*. Transporter proteins knowledge graph construction and its application in drug development. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2023, 21, 2973-2984.

7. Hao Tang, Yanguang Liu, Yao Ruan, Lingqiao Ge and Qing-Ye Zhang*. Reconstructed Genome-Scale Metabolic Model Characterizes Adaptive Metabolic Flux Changes in Peripheral Blood Mononuclear Cells in Severe COVID-19 Patients. International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23: 12400.

8. 王芷涵; 阮耀; 张青叶*; 张红雨*。微重力对拟南芥长势影响的代谢网络流平衡分析。空间科学学报，2022

9. Yao Ruan †, Xiao-Hui Chen †, Feng Jiang, Yan-Guang Liu, Xiao-Long Liang, Bo-Min Lv, Hong-Yu Zhang, Qing-Ye Zhang *. Agent Clustering Strategy Based on Metabolic Flux Distribution and Transcriptome Expression for Novel Drug Development. Biomedicines 2021, 9, 1640.

10. Min-Hui Cao, Bao-He Tang, Yao Ruan, Xiao-Long Liang, Xin-Yi Chu, Zhan-Min Liang, Qing-Ye Zhang*, Hong-Yu Zhang. Development of specific and selective bactericide by introducing exogenous metabolite of pathogenic bacteria. European Journal of Medicinal Chemistry, 2021,225, 113808

11. Xuan Xu †, Qing‐Ye Zhang *,†, Xin‐Yi Chu, Yuan Quan, Bo‐Min Lv and Hong‐Yu Zhang *. Facilitating Antiviral Drug Discovery Using Genetic and Evolutionary Knowledge, Viruses 2021, 13, 2117

12. Liang, Xiao-Long; Liang, Zhan-Min; Wang, Shuo; Chen, Xiao-Hui; Ruan, Yao; Zhang, Qing-Ye*; Zhang, Hong-Yu; An analysis of the mechanism underlying photocatalytic disinfection based on integrated metabolic networks and transcriptional data, Journal of Environmental Sciences, 2020, 92, 28.     

13. Liao, Xuan; Zhang, Qing-Ye*; Xu, Lei; Zhang, Hong-Yu; Potential Targets of Actein Identified by Systems Chemical Biology Methods, ChemMedChem, 2020, 15(6), 473.

14. Cui, Ze-Jia; Zhang, Wei-Tong; Zhu, Qiang*; Zhang, Qing-Ye*; Zhang, Hong-Yu; Using a Heat Diffusion Model to Detect Potential Drug Resistance Genes of Mycobacterium tuberculosis, Protein and Peptide Letters, 2020, 27(8), 711.

15. Tong, Xin-Yu; Liao, Xuan; Gao, Min; Lv, Bo-Min; Chen, Xiao-Hui; Chu, Xin-Yi*; Zhang, Qing-Ye*; Zhang, Hong-Yu; Identification of NUDT5 Inhibitors From Approved Drugs, FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, 2020, 7,44.

已申请专利/软件著作权：

1. 张青叶，刘衍光，于海龙；一种小分子药物设计方法、装置、电子设备及存储介质, 2023-7-28, 中 国, 202310941750.8 (专利) 
   

2. 张青叶，张苗，徐胜臻，江峰，成婷；药物载体、杀菌剂、基于鲍曼不动杆菌的杀菌化合物及其制备方法和应用，2024-2-28，中国，2024102232420 (专利)

3. 张青叶，成婷，张苗，张健；基于铜绿假单胞菌的杀菌化合物及其制备方法和应用，2024-5-10，中国，202410575277.0  (专利)

4. 张青叶，江峰，陈晓慧；种子代谢物筛选器软件, 2022581614984, 原始取得, 全部权利, 2022-10- 06 (软件著作权) 
   

5. 张青叶，陈晓慧，江峰；基于web的致病菌种子代谢物管理系统, 2022581614984, 原始取得, 全部权 利, 2022-7-1 (软件著作权)

6. 张青叶，张红雨，汤保贺，梁小龙，高敏，褚欣奕；基于黄单胞菌外源代谢物的杀菌化合物及制备方 法和应用, 2022-6-7, 中国, 202110317693.7 (专利) 
   

7. 张青叶，齐晓娟，刘梦苑；一种多酚氧化酶（PPO）抑制剂及其制备方法和应用, 2020-4-21, 中国, 201810606714.5 (专利)

8. 张青叶，陈长水，徐胜臻，邓文君； N-乙酰葡萄糖胺-1-磷酸脲苷酰转移酶抑制剂及其制备方法和应 用, 2017-4-5, 中国, 201410312381.7 (专利)

   
   

科研项目：

1. 国家重点研发计划子课题-有益农业微生物种质资源发掘与表征，2024-2027，主持

2. 湖北省农业微生物产业发展重大专项揭榜挂帅项目（课题）--农业微生物专利菌株精准鉴定技术开发，2025-2027，主持

3. 横向课题，基于AI 的新型兽用抗菌药物开发，2025-2028，主持

4. 横向课题，第五代大环内酯类杀菌剂的创制，2023-2026，主持

5. 横向课题，微生物种质资源高通量筛选及产业化开发，2023-2026，主持

6. 横向课题，结直肠癌分子分型的鉴定，2022-2023，主持

7. 中央高校基金-前沿性基础性研究项目，致病菌代谢种子化合物的数据库构建及其在致病机制解析中的作用研究，2022-2024，主持

8. 湖北省科学技术创新专项重大项目（子课题），基于系统遗传学的抗猪乙型脑炎病毒药物的研制，2018-2020，主持

9. 中央高校基金（交叉专项），基于外源代谢物的专一性杀菌剂设计与合成，2018-2020， 主持

10. 湖北省自然科学基金（面上项目），结核分枝杆菌乙酰乳酸合成酶抑制剂的优化设计、合成及构效关系研究，2015-2016，主持

11. 中央高校基金（培育项目），基于靶酶结构的新型抑制剂结构的优化设计与合成，2011-2012，主持

12. 国家自然科学基金（青年基金），GlmU靶酶活性中心与其配体相互作用的机理及其抑制剂先导结构的研究，2010-2012，主持

13. 中国博士后基金（特别资助），基于Glmu靶酶结构的新型抑制剂先导化合物的合理设计与筛选，2009-2011，主持

14. 中国博士后基金（一等资助），苏云金芽胞杆菌YBT-1520的代谢网络调控研究，2008-2010，主持