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孙苗

教师姓名:孙苗
教师英文名称:Miao Sun
教师拼音名称:sunmiao
职称:教授
在职信息:在职
学位:博士学位
办公地点:基因楼505
电子邮箱:
毕业院校:中国科学院植物研究所
其他联系方式

通讯/办公地址:

个人简介

     孙苗男,教授,硕/博士生导师,果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室固定研究人员,研究方向为观赏植物系统演化多样性保护理清物种亲缘关系是生物多样性保护的前提,也是指导观赏植物种质资源保护与产业应用的重要理论依据和基础。一直致力于通过生物大数据(基因/基因组、形态、物种分布数据等)挖掘和比较生物学手段,结合分类学、分子系统学以及物种分布模型等相关成果,研究被子植物蔷薇类(如,胡颓子科、蔷薇科)在起源、演化过程中关键创新性状对生物、非生物因子的响应及形成机制,为园艺创新性状的挖掘和多样性保护提供科学理论基础。曾于2012年10月至2013年01月在美国佛罗里达大学佛罗里达自然历史博物馆(Florida Museum of Natural History, University of Florida)Soltis实验室(Pam Soltis教授与 Doug Soltis教授均为美国科学院院士)做访问学者;2020年3月至2020年8月在美国密西根大学(University of Michigan)生态与进化生物学学院 Stephen Smith 院士实验室做项目合作访问学者。

    在NatureNature CommunicationsPNASSystematic BiologyScience AdvancesMolecular Phylogenetics and Evolution等国际知名刊物上发表论文篇,参编著作共5部,并为Systematic BiologyGlobal Ecology and BiogeographyMolecular Phylogenetics and EvolutionScientific ReportsTaxon等期刊审稿家,中国植物学会、美国植物学会会员,以及数据分析资格培训师(Data and Software Carpentry Instructor)。

教育经历


2009年9月-2014年12月,中国科学院植物研究所,植物学,博士

2006年9月-2009年6月,中国科学院植物研究所,植物学,硕士

2002年9月-2006年6月,北京林业大学,环境科学,学士

工作经历


2022年2月-至今,华中农业大学,园艺林学学院,教授

2019年9月-2021年10月,丹麦奥胡斯大学(Aarhus University, Denmark),生物学院,博士后

2015年1月-2019年8月,美国佛罗里达大学(University of Florida, USA,佛罗里达自然历史博物馆,博士后

课题组(“苗圃”)成员



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  观赏植物系统演化保护课题组(苗圃@2025)


招生专业/方向     


0902Z2观赏园艺学、0907Z1园林植物学

发表论文


目前发表论文共40篇(ORCiD),谷歌学术总引用2624次,参编志书5部。

*代表共同第一作者

#代表共同讯


近期论文

2025:

1. Chen YP, Sunojkumar P, Spicer RA, Hodel RGJ, Soltis DE, Soltis PS, Paton AJ, Sun M, Drew BT, Xiang CL. 2025. Rapid radiation of a plant lineage sheds light on the assembly of dry valley biomes. Molecular Biology and Evolution, msaf011, doi:10.1093/molbev/msaf011.


2024:

1. Zhao LN, Liu Y, Ye JF, Liu B, Hu HH, Lu LM, Chang J, Guralnick RP, Sun M#, Chen ZD#. 2024. Flowering plants at Sino-Himalaya and the Tibetan Plateau face increased extinction risk. Journal of Systematics and Evolution. Online: 2024-12-11.

2. Yan X*, Shi G*, Sun M*, Shan S*, Chen R, Li R, Wu S, Zhou Z, Li Y, Liu Z, Hu Y, Liu Z, Soltis PS, Zhang J, Soltis DE, Ning G, Bao M. 2024. Genome evolution of the ancient hexaploid Platanus × acerifolia (London planetree). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(24):e2319679121.

3. Wang XQ, Xiong T, Wang YY, Zhang XR, Sun M. 2024. Integrating genomic sequencing resources: an innovative perspective on recycling with universal Angiosperms353 probe sets. Horticulture Advances 2: 4.


代表论文(部分)

1. Carruthers T, Sun M, Baker WJ, Smith SA, de Vos JM, Wolf L. Eiserhardt WL. (2021). The implications of topological incongruence between gene trees and the species tree for divergence time estimation. Systematic Biology, syac012. doi:10.1093/sysbio/syac012.

2. Sun M*#, Folk FA*#, Gitzendanner MA, Soltis PS, Chen ZD, Soltis DE, Guralnick RP. (2020). Recent, accelerated diversification in rosids occurred outside the tropics. Nature Communications 11: 3333. doi: 10.1038/s41467-020-17116-5.

3. Sun M*, Folk FA*, Gitzendanner MA, Soltis PS, Chen ZD, Soltis DE, Guralnick RP. (2020). Estimating rates and patterns of diversification with incomplete sampling: A case study in the rosids. American Journal of Botany 107(6): 1–15. doi: 10.1002/ajb2.1479.

4. Sun M, Solits DE, Soltis PS, Zhu XY, Burleigh GJ, Chen ZD. (2015). Deep phylogenetic incongruence in the angiosperm clade RosidaeMolecular Phylogenetics and Evolution 83: 156–166.

5. Lu LM*, Mao L*, Yang T*, Ye JF*, Liu B,* Li HL*, Sun M*, Miller JT, Mathews S, Hu HH, Niu YT, Peng DX, Chen YH, Smith SA, Chen M, Xiang KL, Le CT, Dang VC, Lu AM, Soltis PS, Soltis DE, Li JH, Chen ZD. (2018). Evolutionary history of the angiosperm flora of China. Nature 554: 234–238. doi: 10.1038/nature25485.

6. Sun M, Naeem R, Su JX, Burleigh GJ, Solits DE, Soltis PS, Chen ZD. (2016). Phylogeny of the Rosidae: A dense taxon sampling analysis. Journal of Systematics and Evolution 54(4): 363–391.

7. Sun M, Lin Q. (2010). A revision of Elaeagnus L. (Elaeagnaceae) in mainland China. Journal of Systematics and Evolution 48(5): 356–390.

8. Lichman BR, Godden GT, Hamilton JP, Lira Palmer L, Kamileen MO, Zhao D, Vaillancourt B, Wood J, Sun M, Henry LK, Lopez CR, Dudareva N, Soltis DE, Soltis PS, Buell CR, O’Connor SE. (2020). The evolutionary origins of the cat attractant nepetalactone in catnip. Science Advances 6: eaba0721. doi: 10.1126/sciadv.aba0721.

9. Yang T, Tedersoo L, Soltis PS, Soltis DE, Gilbert JA, Sun M, Shi Y, Wang HF, Li YT, Zhang J, Chen ZD, Lin HY, Zhao YP, Fu CX, Chu HY. (2018). Phylogenetic imprint of woody plants on the soil mycobiome in natural mountain forests of eastern China. The ISME Journal 13: 686–697. doi: 10.1038/s41396-018-0303-x.

10. Mu XY, Sun M, Yang PF, Lin QW. (2017). Unveiling the identity of Wenwan walnuts and phylogenetic relationships of Asian Juglans species using restriction Site-associated DNA-sequencing. Frontiers in Plant Science (8): 1708. doi: 10.3389/fpls.2017.01708.

11. Hodel RG, Segovia-Salcedo MC, Landis JB, Crowl AA, Sun M, Liu XX, Gitzendanner MA, Douglas NA, Germain-Aubrey CC, Chen SC, Soltis DE, Soltis PS. (2016). The report of my death was an exaggeration: A review for researchers using microsatellites in the 21st century. Applications in Plant Sciences 4(6): 1600025.

12. Chen ZD, Yang T, Li Lin, Lu LM, Li HL, Sun M, Liu B, Chen M, Niu YT, Ye JF, Cao ZY, Liu HM, Wang XM, Wang W, Zhang JB, Meng Z, Cao W, Li JH, Wu SD, Zhao HL, Liu ZJ, Du ZY, Wang QF, Guo J, Tan XX, Su JX, Zhang LJ, Yang LL, Liao YY, Li MH, Zhang GQ, Chung SW, Zhang J, Xiang KL, Li RQ, Soltis DE, Soltis PS, Zhou SL, Ran JH, Wang XQ, Jin XH, Chen YS, Gao TG, Li JH, Zhang SZ, Lu AM. (2016). Tree of life for the genera of Chinese vascular plants. Journal of Systematics and Evolution 54(4): 227–306.


主持(参与)项目


  • 2023-012026-12国家自然科学基金委面上项目,主持人和主要完成人,在研

  • 2024-01至2027-12,入选首批国家博士后海外引才计划主持人和主要完成人,在研

  • 2023-092028-08果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室自主培育项目,参与,在研

  • 2023-01至2026-12, 2022年度“武汉英才”产业领军人才,主持人和主要完成人,在研

  • 2022-01至2027-12,高层次人才启动经费,主持人和主要完成人,在研


  • 2019-012024-09,Explaining the biological hyperdiversity of tropical rainforests using the Tree of Life (TropiToL),重点项目/丹麦VILLUM FONDEN基金会1,000万丹麦克朗博士后,完成人之一,大数据分析,生命之树重建

  • 2017-102021-12Startup Funds for Advanced Talents 导师启动经费/丹麦Aarhus University Research Foundation (AUFF),300万丹麦克朗,博士后,完成人之一,大数据分析,生命之树重建

  • 2015-012020-12,Dimensions US-China: Collaborative Research: How historical constraints, local adaptation, and species interactions shape biodiversity across an ancient floristic disjunction,国际合作/美国National Science Foundation,200万美元,博士后第二课题,材料收集、分子实验和基因组数据分析

  • 2012-012015-12,Assembling visualizing, and analyzing the Tree of Life 重点项目/美国National Science Foundation,107万美元,博士后第一课题,分子实验和数据分析

  • 2012-012016-12 蔷薇类COM分支的系统发育研究 面上项目/国家自然科学基金面上项目 80万元 主要完成人,博士毕业论文课题,材料收集、分子实验和数据分析



参与专著

《中国国家植物标本馆(PE)模式标本集》第6710

《中国维管植物生命之树》锦葵科、卫矛科和金虎尾科

《中国维管植物科属志》锦葵科、卫矛科和金虎尾科

《中国维管植物科属词典志》锦葵科、卫矛科和金虎尾科

《中国高等植物彩色图鉴》第五卷胡颓子科

《植物系统学》(迈克·辛普森,第二版翻译)

《伟大生命之树》陈士超、孙苗 主译)



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更新时间:2025年04月28日

 


教育经历

[1] 2009.9——2014.12
中国科学院植物研究所 > 植物学 > 博士学位 > 研究生(博士后)
[2] 2006.9——2009.7
中国科学院植物研究所 > 植物学 > 硕士学位 > 研究生(硕士)毕业
[3] 2002.9——2006.7
北京林业大学 > 环境科学 > 学士 > 学士

工作经历

[1] 2022.2-至今
华中农业大学 > 园艺林学学院 > 在职
[2] 2019.10-2021.9
丹麦奥胡斯大学 > 生物学院 > 博士后已离职
[3] 2015.1-2019.8
美国佛罗里达大学 > 佛罗里达自然历史博物馆 > 博士后已离职