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赵伦

博士生导师
教师姓名:赵伦
教师拼音名称:Zhao Lun
所在单位:植物科学技术学院
办公地点:华中农业大学 作物遗传改良国家重点实验室A307-2
学位:博士
职称:教授
毕业院校:华中农业大学
所属院系:植物科学技术学院
学科:作物遗传育种    
其他联系方式

通讯/办公地址:

个人简介

赵伦,中共党员,教授、博士生导师,作物遗传改良国家重点实验室和油菜遗传改良创新团队成员。主要从事油菜遗传改良研究,将传统遗传学研究结合基因组、转录组、表观基因组和三维基因组等多组学手段,解析油菜重要农艺性状形成的遗传和表观遗传调控机制。阐明了油菜杂种优势利用途径化学杀雄的分子机理,发现了除草剂“稳态耐性”新机制;开发/改进了植物表观和三维基因组领域的关键核心技术eChIP-seq和ChIA-PET,构建了首张油菜参考表观基因组图谱,揭示了亚基因组间转录不平衡的表观遗传学基础;绘制了水稻参考表观基因组图谱和高分辨率的三维基因组图谱,发现了具有增强子活性的启动子,揭示了遗传变异通过改变三维基因组结构远程调控基因转录和重要农艺性状形成的机制。研究结果发表在Nature Communications、Autophagy、Molecular Plant、Genome Biology、Plant Biotechnology Journal、Plant Journal和Journal of Integrative Plant Biology等重要期刊,为解析油菜重要农艺性状调控机制和作物遗传改良提供了新技术、新视角和新思路。担任Genome Biology等期刊审稿人。

    先后主持国家自然科学基金、国家重点研发计划子课题和中国博士后基金等项目。获得上海市“超级博士后”和武汉市“青年英才”等资助和称号。

    

研究方向

       以模式植物拟南芥和异源多倍体甘蓝型油菜等主要研究对象,从事植物表观遗传学、表观基因组学和三维基因组学研究。

1. 植物DNA(去)甲基化调控机制

2. 不同类型表观遗传修饰的协作机制

3. 甘蓝型油菜多倍体优势形成的遗传与表观遗传调控机制

4. 甘蓝型油菜重要农艺性状的调控机制


      热诚欢迎有志从事作物遗传改良和生物信息分析的学生报考本实验室硕士、博士研究生。

      本实验室招聘生物学实验和生信分析相关方向博士后若干名,有意者请将个人简历发送至本人邮箱。博士后招聘信息:http://rsc.hzau.edu.cn/info/1013/2790.htm


科研项目

1. 十四五国家重点研发计划子课题,油菜和棉花全景多维组学分析,2021-2026,主持

2. 华中农业大学新进高层次人才科研启动项目,2021-2025,在研,主持

3. 武汉英才项目,2022-2023,主持

4. 上海市“超级博士后”项目,植物DNA甲基化相关的三维基因组学研究,2019-2020,主持

5. 国家自然科学基金,植物eChIP-seq技术的建立与甘蓝型油菜表观基因组图谱的构建,2018-2020,主持

6. 中国博士后基金,植物高效ChIP-seq技术的建立及其应用,2017-2018,主持

7. 国家自然科学基金,水稻三维基因组结构及其与表观遗传修饰的关系研究,2018-2021,参与

8. 国家自然科学基金,适合机械化生产的甘蓝型油菜株型性状QTL定位,2009-2012,参与


学术论文与著作(*通讯作者,#共同第一作者):

学术论文

1. Zhao L, Jing X, Chen L, Liu Y, Su Y, Liu T, Gao C, Yi B, Wen J, Ma C, Tu J, Zou J, Fu T, Shen J*. Tribenuron-methyl induces male sterility through anther-specific inhibition of acetolactate synthase leading to autophagic cell death, Molecular Plant, 2015. 8(12):1710-1724. doi: 10.1016/j.molp.2015.08.009.

2. Zhao L#, Deng L#, Zhang Q, Jing X, Ma M, Yi B, Wen J, Ma C, Tu J, Fu T, Shen J*. Autophagy contributes to sulfonylurea herbicide tolerance via GCN2-independent regulation of amino acid homeostasis. Autophagy. 2018. 14(4):702-714. doi: 10.1080/15548627.2017.1407888. (#equal contribution).

3. Zhao L#, Wang S#, Cao Z#, Ouyang W, Zhang Q, Xie L, Zheng R, Guo M, Ma M, Hu Z, Sung WK, Zhang Q, Li G*, Li X*. Chromatin loops associated with active genes and heterochromatin shape rice genome architecture for transcriptional regulation. Nature Communications. 2019. 10(1):3640. doi: 10.1038/s41467-019-11535-9. (#equal contribution).

4. Zhao L#, Xie L#, Zhang Q#, Ouyang W, Deng L, Guan P, Ma M, Li Y, Zhang Y, Xiao Q, Zhang J, Li H, Wang S, Man J, Cao Z, Zhang Q, Zhang Q, Li G*, Li X*. Integrative analysis of reference epigenomes in 20 rice varieties. Nature Communications. 2020. 11(1):2658. doi: 10.1038/s41467-020-16457-5. (#equal contribution).

5. Zhang Q#, Guan P#, Zhao L#, Ma M, Xie L, Li Y, Zheng R, Ouyang W, Wang S, Li H, Zhang Y, Peng Y, Cao Z, Zhang W, Xiao Q, Xiao Y, Fu T, Li G*, Li X* & Shen J*. Asymmetric epigenome maps of subgenomes reveal imbalanced transcription and distinct evolutionary trends in Brassica napus. Molecular Plant. 2021. 14(4):604-619. doi: 10.1016/j.molp.2020.12.020. (#equal contribution).

6. Tang K#, Zhao L#, Ren Y#, Yang S, Zhu JK, Zhao C*. The transcription factor ICE1 functions in cold stress response by binding to the promoters of CBF and COR genes. Journal Integrative Plant Biology. 2020. 62(3):258-263. doi: 10.1111/jipb.12918. (#equal contribution).

7. Peng Y#, Xiong D#, Zhao L, Ouyang W, Wang S, Sun J, Zhang Q, Guan P, Xie L, Li W, Li G*, Yan J*, Li X*. Chromatin interaction maps reveal genetic regulation for quantitative traits in maize. Nature Communications. 2019 14;10(1):2632. doi: 10.1038/s41467-019-10602-5.

8. Wang G, Zhang X, Huang W, Xu P, Lv Z, Zhao L, Wen J, Yi B, Ma C, Tu J, Fu T, Shen J. Increased seed number per silique in Brassica juncea by deleting cis-regulatory region affecting BjCLV1 expression in carpel margin meristem. Plant Biotechnology Journal. 2021. 19(11):2333-2348. doi:10.1111/pbi.13664.

9. Huang P#, Huang H#, Lin X, Liu P, Zhao L, Nie WF, Zhu JK, Lang Z. MSI4/FVE is required for accumulation of 24-nt siRNAs and DNA methylation at a subset of target regions of RNA-directed DNA methylation. Plant Journal. 2021. 108(2):347-357. doi: 10.1111/tpj.15441.

10.  Xie L, Liu M, Zhao L, Cao K, Wang P, Xu W, Sung WK, Li X, Li G. RiceENCODE: A comprehensive epigenomic database as a rice Encyclopedia of DNA Elements. Molecular Plant. 2021. 14(10):1604-1606. doi: 10.1016/j.molp.2021.08.018.

11.  Deng L#, Gao B#, Zhao L, Zhang Y, Zhang Q, Guo M, Yang Y, Wang S, Xie L, Lou H, Ma M, Zhang W, Cao Z, Zhang Q, McClung CR, Li G, Li X*. Diurnal RNAPII-tethered chromatin interactions are associated with rhythmic gene expression in rice. Genome Biology. 2022. 23(1):7. doi: 10.1186/s13059-021-02594-7.

12.  He L, Huang H, Bradai M, Zhao C, You Y, Ma J, Zhao L, Lozano-Duran R, and Zhu JK. DNA methylation-free Arabidopsis reveals crucial roles of DNA methylation in regulating gene expression and development. Nature Communications. 2022. 13:1335. doi: 10.1038/s41467-022-28940-2.

13.  Wan H#, Qian J#, Zhang H, Lu H, Li O, Li R, Yu Y, Wen J, Zhao L, Yi B, Fu T, Shen J*. Combined Transcriptomics and Metabolomics Analysis Reveals the Molecular Mechanism of Salt Tolerance of Huayouza 62, an Elite Cultivar in Rapeseed (Brassica napus L.). International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23(3): 1279. doi: 10.3390/ijms23031279.

出版著作

1. 赵伦,沈金雄. 第六章, 油菜化学杀雄杂种利用研究. 涂金星等著. 油菜杂种优势利用的生物学基础. 2018. 北京, 科学出版社.  ISBN 978-7-03-058545-5. 219-236页



教育经历

[1] 2009.9——2015.12
华中农业大学 > 作物遗传育种 > 博士
[2] 2005.9——2009.6
华中农业大学 > 农学 > 学士

工作经历

[1] 2021.5-至今
华中农业大学植物科技学院
教师 

[2] 2020.2-2021.1
美国普渡大学
博士后 

[3] 2019.5-2020.1
中科院上海生命科学研究院
博士后 

[4] 2016.1-2019.4
华中农业大学生物学博士后流动站
博士后 

研究方向

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