周雄辉，男，2009年6月获得暨南大学计算机科学与技术系工学学士，2009年9月开始于武汉大学计算机学院硕博连读，研究方向为生物信息学，并于2014年6月获得工学博士学位。并于2019年4月到2020年10月在辛辛那提儿童医院医学中心做研究员，进行液体活检领域的研究。现在为华中农业大学信息学院副教授。实验室主要关注机器学习方法以及其在生物医学和农业领域中的应用研究。欢迎信息、生物等背景的同学（硕士生：计算机学硕，生物信息学硕，电子信息专硕，生物与医药专硕；博士生：电子信息，农业人工智能+）加入课题组，课题组详细信息见：https://dmpmlab.github.io/index.html

主要教育与工作经历：

2005年9月 - 2009年6月 暨南大学 计算机科学与技术 学士

2009年9月 - 2014年6月 武汉大学 计算机学院 计算机应用技术 博士 导师：刘娟

2010年3月 - 2011年9月 航天医学与工程国家重点实验室 客座研究生 导师：熊江辉

2019年4月 - 2020年10月 辛辛那提儿童医院 Research fellow 导师：Yaping Liu

2014年7月 - 至今 华中农业大学 信息学院 讲师、副教授

科研项目：

1. 基于DNA甲基化交互网络的癌症hallmark挖掘及其在癌症转移biomarker筛选中的应用，国家自然科学基金委员会，青年项目，61602201, 2017.1-2019.12, 20万，已结题，主持。

2. 玉米基因-表型关系发现模型研发，农业农村部，科技创新2030—重大项目子课题,  2023ZD0406101-3, 2023.9 – 2025.12, 100万，在研，主持。

3. 基于DNA甲基化交互网络的癌症hallmark挖掘及其在癌症预后中的应用研究，湖北省自然科学基金委员会，青年基金, 2016CFB139, 2016.1-2017.12, 5万，已结题，主持。

4. 基于GeneRank的乳腺癌亚型精准医疗，华中农业大学，自主科研基金，09002021122, 2018.1-2020.12, 30万，已结题，主持。

5. 基于尿液cell-free DNA测序数据的基因组开放区域预测及其在膀胱癌早期诊断中的应用，华中农业大学校自主基金，2023.04-2024.12, 15万，在研，主持。

6. 基于多数据融合的癌症转移关键基因挖掘及预后研究，华中农业大学，新进博士科研启动专项, 2662014BQ0821, 2014/10-2015/12, 5万元，已结题，主持。

代表性论文：

1. Yuyin Hou, Xiangyu Meng*, Xionghui Zhou*. Systematically Evaluating Cell-Free DNA Fragmentation Patterns for Cancer Diagnosis and Enhanced Cancer Detection via Integrating Multiple Fragmentation Patterns. Advanced Science. 2024：doi.org/10.1002/advs.202308243 (中科院1区top期刊, IF = 15.1)。

2. Xionghui Zhou, Zheng H, Fu H, McKillip KL, Pinney SM, Liu Y. CRAG: de novo characterization of cell-free DNA fragmentation hotspots in plasma whole-genome sequencing. Genome Medicine. 2022;14(1):138（中科院1区top期刊， IF = 12.3)。

3. Kuan Xie, Yuyin Hou, Xionghui Zhou*. Deep centroid: a general deep cascade classifier for biomedical omics data classification. Bioinformatics. 2024; 40(2): btae039 (CCF B类期刊，IF = 5.8,领域无A类期刊/会议).

4. Peiting Shi#, Junming Han#,Yinhao Zhang, Guanpu Li, Xionghui Zhou*. IMI-driver: integrating multi-level gene networks and multi-omics for cancer driver gene identification. PLoS Computational Biology. 2024:e1012389 (CCF B类期刊，IF = 4.3, 领域无A类期刊/会议).

5.Meng X#, Zhou X#, Li S#, Shi M#, Li X, Yang B, et al. Detection of bladder cancer by urine cfDNA fragmentation hotspots that capture cancer associated molecular features.Clinical Chemistry. 2024: hvae156.  (中科院医学实验技术领域1区top期刊，IF = 9.3)。

6. Haoyang Zhang, Sha Liu, Bingxin Li, Xionghui Zhou*. IPFMC: An Iterative Pathway Fusion Approach for Enhanced Multi-omics Clustering in Cancer Research. Briefings in Bioinformatics.2024, 25(6): bbae541 (CCF B类期刊，IF = 6.8).